发明专利 已授权

一种适用于ATAC-seq测序的玉米胚乳提核方法

📄 申请号:CN202411245048.9 📄 发布日:2026/07/06

著录项目信息

申请日
2024-09-06
公开号
CN118879831B
公开日
2025-10-03
申请人
安徽农业大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

植物表观遗传学研究, 作物分子育种, 基因表达调控分析, 玉米功能基因组学, 植物组织细胞核分离

摘要

本发明公开了一种适用于ATAC‑seq测序的玉米胚乳提核方法。包括以下步骤:(1)从玉米种子中取出种皮,胚,收集胚乳,长期可保存于‑80℃中,胚乳取大约5g,在液氮中手动研磨成粉末;(2)将10mL体积的蔗糖缓冲液添加到每份粉末样品中,充分混匀,再通过100um孔筛过滤;(3)将步骤(2)的滤液再通过38um孔网,然后将产物700×g离心5分钟,收集上清液;(4)将上清液通过38um筛网过滤并2000×g离心5分钟,去除上清液,然后将沉淀重新悬浮在10mL蔗糖缓冲液中;(5)再次通过38um筛孔过滤,2000×g离心5‑10分钟,去除上清液,然后将沉淀重悬于5mL的重悬缓冲液;(6)再1000×g离心5分钟后,弃去上清液,将沉淀悬浮在5mL的含有蛋白酶抑制剂的pbs溶液中,取10‑20uL使用DAPI等体积染色10分钟,在荧光显微镜下观察。本发明制备得到的胚乳细胞核数量多、活性高,可以克服储藏组织淀粉含量高的影响,为后续单细胞测序、CUT&TAG、ATAC‑seq等相关研究提供有力的技术支持,提取效果也会对实验数据产生重要的影响。

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