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本发明公开了一种适用于ATAC‑seq测序的玉米胚乳提核方法。包括以下步骤：(1)从玉米种子中取出种皮，胚，收集胚乳，长期可保存于‑80℃中，胚乳取大约5g，在液氮中手动研磨成粉末；(2)将10mL体积的蔗糖缓冲液添加到每份粉末样品中，充分混匀，再通过100um孔筛过滤；(3)将步骤(2)的滤液再通过38um孔网，然后将产物700×g离心5分钟，收集上清液；(4)将上清液通过38um筛网过滤并2000×g离心5分钟，去除上清液，然后将沉淀重新悬浮在10mL蔗糖缓冲液中；(5)再次通过38um筛孔过滤，2000×g离心5‑10分钟，去除上清液，然后将沉淀重悬于5mL的重悬缓冲液；(6)再1000×g离心5分钟后，弃去上清液，将沉淀悬浮在5mL的含有蛋白酶抑制剂的pbs溶液中，取10‑20uL使用DAPI等体积染色10分钟，在荧光显微镜下观察。本发明制备得到的胚乳细胞核数量多、活性高，可以克服储藏组织淀粉含量高的影响，为后续单细胞测序、CUT&TAG、ATAC‑seq等相关研究提供有力的技术支持，提取效果也会对实验数据产生重要的影响。