本发明涉及一种新果胶酶的基因，所述基因为序列表中SEQ ID NO.1的核苷酸序列所示；或者是与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列具有90％以上同源性且编码相同生物学功能蛋白质的序列；或者是能与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列杂交且编码相同生物学功能蛋白质的序列。本发明如序列表中SEQ ID NO.1的核苷酸序列可以利用pET32载体和大肠杆菌表达菌株，实现了表达产物与增溶因子Trx融合，得到大量可溶形式的Trx‑果胶酶融合蛋白，并通过镍亲和层析和DEAE阴离子交换法纯化得到高纯度和高活性的重组果胶酶蛋白，为大量制备重组果胶酶提供基础。
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