本发明公开了一种源于簇毛麦的小麦抗白粉病基因Pm21的KASP分子标记及其应用,所述KASP分子标记为KASP‑Pm21,其KASP分子标记KASP‑Pm21的引物包括簇毛麦等位型上游引物KASP‑Pm21‑F、小麦等位型上游引物KASP‑Pm21‑H以及共用下游引物KASP‑Pm21‑C;所述簇毛麦等位型上游引物KASP‑Pm21‑F的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述小麦等位型上游引物KASP‑Pm21‑H的核苷酸序列如SEQ ID NO:2所示;所述共用下游引物KASP‑Pm21‑C的核苷酸序列如SEQ ID NO:3所示。本发明提供的源于簇毛麦的小麦抗白粉病基因Pm21的KASP分子标记KASP‑Pm21,可实现Pm21基因的高效追踪和检测,应用于小麦抗白粉病Pm21基因的分子标记辅助选择育种。