本发明属于辣椒分子育种技术领域,公开了一种调控辣椒素生物合成候选基因的KASP分子标记、引物、试剂盒和应用。该KASP分子标记的侧翼核苷酸序列如SEQ ID No:1所示。所述引物包括如SEQ ID No:2的正向引物1、如SEQ ID No:3的正向引物2和如SEQ ID No:4的反向引物。所述试剂盒包括所述引物。本发明还提供一种所述引物或所述试剂盒在鉴定和辅助筛选辣椒是否含辣椒素、用于辣椒果实不辣突变体鉴定、筛选或者辅助育种中的应用。本发明所开发的分子标记、引物及试剂盒,能够快速筛选出目标植株,有效缩减种植规模,降低后期田间鉴定工作量,从而提升选择效率与准确性。