本发明涉及油茶分子标记及遗传育种技术领域,具体涉及与油茶单果质量相关的DNA片段、其紧密连锁的SNP分子标记及其应用。本发明提供与油茶单果质量相关的DNA片段,其为位于油茶连锁图谱10号连锁群的wsf.10‑1,置信区间为95.61cM‑95.62cM。本发明还提供与油茶单果质量位点紧密连锁的SNP分子标记chr10_122184778,其为含有如SEQ ID NO.1所示序列第174位的多态性为A/G的核苷酸序列,可以解释55.2%的油茶单果质量的表型方差。通过检测该SNP分子标记,可在苗期对油茶单果质量表型进行鉴定和辅助筛选,大大节约了生产成本,有效提高了油茶果实大小选择育种的效率。