本发明涉及一种具有较高热稳定性的D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶及其突变体A13S/V235I以及编码基因,以及在微生物催化D‑果糖异构化制备D‑阿洛酮糖中的应用,解决了目前D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶在工业生产中热稳定性差的技术问题。所述D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶突变体由SEQ ID NO.2所示氨基酸经定点突变而得。本发明有益效果主要体现在:本发明提供了一种全新的热稳定性提高的D‑阿洛酮糖3‑差向异构酶及其突变体,该突变体具有高最适反应温度70℃,解决了现有酶无法在高温生产或其在高温下迅速失活的阻碍制备D‑psicose的技术难题。热稳定性优于原始酶和其他突变酶,具有较好工业应用前景。