本发明涉及一种果胶酶人工序列及其表达方法和应用，该基因至少含有下列核苷酸序列之一的DNA片：1)序列表中SEQ ID NO.1的核苷酸序列；2)与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列具有90％以上同源性、且编码相同生物学功能蛋白质的核苷酸序列；或3)与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列杂交且编码相同生物学功能蛋白质的核苷酸序列。按照本发明所述的基因序列进一步构建重组载体并转化酵母，可实现该重组果胶酶在甲醇诱导下的分泌表达，通过DEAE阴离子交换纯化，可得到纯度高于95％活性重组果胶蛋白，该活性酶蛋白具有很强的澄清果汁的活性。
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