本发明属于植物基因工程技术领域,具体涉及水稻类异戊二烯合成相关蛋白DXR在调控水稻叶色中的应用。本发明要解决的技术问题是对水稻DXR蛋白开展功能研究,为水稻的后续分子设计育种奠定基础。本发明的技术方案是水稻类异戊二烯合成相关蛋白DXR在调控水稻叶色中的应用,氨基酸序列如SEQ ID No.2所示。本发明还提供了调控水稻叶色的方法,包括如下步骤:将调控DXR蛋白表达的重组载体、含有该重组载体的转基因细胞系或重组菌转化水稻,培育筛选,获得目标叶色的水稻。本发明通过实验验证了水稻类异戊二烯合成相关蛋白DXR的作用,明确了该蛋白参与了水稻的叶绿素合成,可用于调控水稻叶色,对水稻遗传改良具有重要的意义。