本公开提供了一种猫冠状病毒S蛋白mRNA的体外转录系统及其构建方法,包括如下步骤:对猫冠状病毒S蛋白mRNA序列进行修饰和优化;将设计好的S蛋白基因片段连接体外转录载体,构建pGEM‑S重组质粒,转入大肠杆菌大量培养,并提取质粒进行线性化处理及胶回收,以获得体外转录的DNA模板;通过体外转录反应获得FCoV S mRNA,并进行加帽及纯化。用同样的技术路线构建了pGEM‑EGFP载体,体外转录成EGFP mRNA;以EGFP mRNA作为报告基因进行细胞转染实验,并在体外转染多种细胞系以验证IVT‑mRNA系统。本发明人首次构建了猫冠状病毒S蛋白mRNA的体外转录系统,可以在细胞水平上高效表达目的蛋白,并可以在不同细胞系中应用,为后期制备猫冠状病毒mRNA疫苗提供了基础。