本发明公开了一种柑橘CsGSTF1基因及其应用,所述柑橘CsGSTF1基因是柑橘溃疡病的感病基因,其核苷酸序列为SEQ ID NO:1所示或者在SEQ ID NO:1所示核苷酸序列经取代、缺失或添加一个或几个核苷酸且具有编码同等活性蛋白的核苷酸序列;应用方法具体包括以下步骤:(1)克隆柑橘CsGSTF1基因的VIGS片段;(2)构建VIGS的表达载体;(3)VIGS表达载体转化柑橘,得到柑橘CsGSTF1基因被沉默的VIGS植株。本发明首次克隆获得柑橘CsGSTF1基因,并利用VIGS沉默降低柑橘CsGSTF1的转录水平,验证了CsGSTF1在柑橘溃疡病抗感性中的功能;获得的VIGS沉默植株的H2O2含量明显升高,对柑橘溃疡病抗性大大增强,溃疡病的发病程度显著降低,在柑橘抗溃疡病育种中具有重大的应用价值。