本发明涉及一种葡萄VvFLS3基因及其在抗高温中的应用,属于植物基因工程技术领域。在本发明中一种葡萄VvFLS3基因其CDS序列如SEQ ID NO.1所示。本发明发现过表达葡萄VvFLS3具有提高其抗高温的功能,其过表达植物可以通过促进体内槲皮素含量积累、提高黄酮醇合酶FLS(Flavonol synthase)的活性,降低葡萄叶片细胞膜透性和丙二醛(Malondialdehyde,MDA)含量,提高葡萄叶片PSII反应中心的光化学效率以及抗氧化酶活性来增强其抗高温能力。因此,本发明在提高植物抗高温胁迫方面具有重要意义。