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摘 要:一种基于接触图的蛋白质结构比对方法,首先根据输入的两个待比对蛋白质的三维结构信息,分别计算两个蛋白质的接触图信息;其次从任一蛋白质接触图中抽取对应蛋白质中的每个氨基酸的周边接触信息;然后根据氨基酸残基的周边接触信息,计算两个蛋白质的相似得分矩阵,得分矩阵中的任一元素都表示来自不同蛋白质的对应氨基酸之间的相似性;再次根据相似得分矩阵,使用动态规划算法获取两个待比对蛋白质的比对信息;最后,使用TM‑score工具计算两个待比对蛋白质之间的结构相似性得分,并获得它们在三维空间上的比对状态。本发明提供一种计算代价低、比对精度高的基于接触图的蛋白质结构比对方法。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201910240720.8 | 专利名称: | 一种基于接触图的蛋白质结构比对方法 |
申请日: | 2019-03-28 | 申请/专利权人 | 浙江工业大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B15/00搜分类 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
解除代理委托书(需盖公章)一式两份(如专利通过代理机构申请) | 解除代理委托书(需签字)一式两份(如专利通过代理机构申请) | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2022/11/18 | 专利权的转移 | 登记生效日: 2022.11.07 专利权人由广州肇基生物科技有限公司变更为深圳新锐基因科技有限公司 地址由510000 广东省广州市越秀区水荫路117号星光映景3层N2248号变更为518000 广东省深圳市南山区粤海街道滨海社区海天一路19、17、18号软件产业基地4栋D1101 |
2021/02/26 | 授权 | |
2019/09/06 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 15/00 专利申请号: 201910240720.8 申请日: 2019.03.28 |
2019/08/13 | 公开 |