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摘 要:本发明提供一种基于Python语言的基因变异检测方法及系统,方法包括:S1:确定Query蛋白序列及多个物种的基因组序列信息;S2:Blast比对分析后整合,得到每个Query蛋白序列的比对区域信息;S3:创建并初始化列表与集合,依次比对Query蛋白序列与集合,将所有Query蛋白序列全部写入列表中获得每个Query蛋白序列的最佳比对结果信息;S4:去除Query蛋白序列中没有比对到的序列,得更新Query蛋白序列;S5:将更新的Query蛋白序列与下一物种的序列比对库比对,并循环步骤S2‑S4,直到获得Query蛋白序列的每个物种的最佳比对结果信息;S6:设置抽取长度基数,结果抽取Query蛋白序列在不同物种的每个外显子的数目信息和变异情况并记录。该方法能缩短比对时间,提高有效比对速率,完成基因检测。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202110016893.9 | 专利名称: | 基于 Python 语言的基因变异检测方法及系统 |
申请日: | 2021-01-07 | 申请/专利权人 | 内江师范学院 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 四川省内江市东兴区东桐路内江师范学院西区教工宿舍3栋三单元302 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B20/20搜分类 基因工程 P HO 检测搜索 |
公开/公告日: | 2021-04-09 | 转让价格: | 面议 |
公开/公告号: | CN112634988A | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
解除代理委托书(需盖公章)一式两份(如专利通过代理机构申请) | 解除代理委托书(需签字)一式两份(如专利通过代理机构申请) | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2021/10/08 | 授权 | |
2021/04/27 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 20/20 专利申请号: 202110016893.9 申请日: 2021.01.07 |
2021/04/09 | 公开 |