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专利名称:
基于 Python 语言的基因变异检测方法及系统
申请号:
2021100168939
转让价格:面议
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法律状态:已下证 类型:发明 关键词:
Python编程 基因检测 基因测序 生物检测 生物遗传 生命科学 健康医疗 智慧医疗
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发布日:2025/07/09
摘要: 本发明提供一种基于Python语言的基因变异检测方法及系统,方法包括:S1:确定Query蛋白序列及多个物种的基因组序列信息;S2:Blast比对分析后整合,得到每个Query蛋白序列的比对区域信息;S3:创建并初始化列表与集合,依次比对Query蛋白序列与集合,将所有Query蛋白序列全部写入列表中获得每个Query蛋白序列的最佳比对结果信息;S4:去除Query蛋白序列中没有比对到的序列,得更新Query蛋白序列;S5:将更新的Query蛋白序列与下一物种的序列比对库比对,并循环步骤S2‑S4,直到获得Query蛋白序列的每个物种的最佳比对结果信息;S6:设置抽取长度基数,结果抽取Query蛋白序列在不同物种的每个外显子的数目信息和变异情况并记录。该方法能缩短比对时间,提高有效比对速率,完成基因检测。
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