一种基于渐进式神经网络预测蛋白质与配体结合自由能的方法

摘     要：本发明公开了一种基于渐进式神经网络预测蛋白质与配体结合自由能的方法，属于计算机辅助药物设计技术领域，包括从PDBbind数据库中获取pdb文件，建立本地数据库，以配体分子为中心获取蛋白质结合口袋内4.5埃距离内的氨基酸分子，进行扩展连通性指纹计算，进行SPLIF指纹计算，查找蛋白质与配体分子之间的盐桥与氢键数目，将蛋白质与配体的结构信息转变成一维张量，建立训练集、验证集、测试集，利用训练集训练渐进式神经网络，优化寻找超参数进行预测，通过与分子对接结果的对照，获得了更高的皮尔森相关系数，解决了如何将蛋白质与配体分子的三维结构转变为计算机易于计算的张量、并输入到渐进式神经网络中进行训练与优化的技术问题，极大加快了计算速率和预测准确性。

著 录 项： 

• 1． 买家选定所需专利，确认国家手续办理方，下单，确认交易合同；
  2． 卖家确认专利可交易；
  3． 买家支付交易款项到平台；
  4． 买卖双方签订《专利转让委托书》、《转让协议》、《解除代理委托书》各一式两份并提交给办理国家手续方；
  5． 办理国家手续方提交办理官方手续，国家知识产权局1个月左右下发《著录项目变更手续合格通知书》；
  6． 买家确认收到《专利证书》、《著录项目变更手续合格通知书》；
  7． 平台把交易款项支付给卖家，至此专利转让合同完成。
  

• 交易方	企业	个人
  买家	营业执照副本复印件（需盖公章）	身份证复印件（签字）
  	专利转让委托书（需盖公章）一式两份	专利转让委托书（需签字）一式两份
  	专利转让协议（需盖公章）一式两份	专利转让协议（需签字）一式两份
  卖家	营业执照副本复印件（需盖公章）	身份证复印件（需申请人签字）
  	解除代理委托书（需盖公章）一式两份（如专利通过代理机构申请）	解除代理委托书（需签字）一式两份（如专利通过代理机构申请）
  	专利转让协议（需盖公章）一式两份	专利转让协议（需签字）一式两份
  	专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件	专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件
  	专利证原件（若授权下证）	专利证原件（若授权下证）

• 日期

  法律信息

  备注