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摘 要:本发明公开了一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法,下载拟南芥、欧洲油菜和稻三个样本的线粒体全基因组序列,提取位点信息;融合烟草ATP合酶上的atp9,atp6,orf25,orfB,atp1五个目的基因的DNA序列和cDNA序列比对得到的编辑位点数据共同组成数据集;从全基因组中得到负样本;确定最优特征;针对最优特征,对训练集-测试集按照9:1、8:2、7:3、6:4、5:5进行分类,基于高维特征快速非线性汰选方法对五种比例的训练集-测试集中的训练集进行高维特征筛选;基于高维特征筛选后保留的有效特征,利用SVC分别对测试集和验证集进行独立预测,得到有效模型;确定最优模型;本发明适用于烟草线粒体RNA编辑位点预测,减少了预测的计算量,并保证了预测的高精度。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201810468630.X | 专利名称: | 一种烟草线粒体RNA编辑位点高精度预测方法 |
申请日: | 2018-05-16 | 申请/专利权人 | 湖南农业大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 湖南省长沙市芙蓉区农大路1号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G06F19/18搜分类 烟草 高精度 R 港口搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2021/06/25 | 授权 | |
2018/10/26 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G06F 19/18 专利申请号: 201810468630.X 申请日: 2018.05.16 |
2018/09/28 | 公开 |