摘要
本发明提供了一种蛋白分子机器的运动模式模拟方法,包括:S10获取蛋白分子机器结构数据文件;S20对蛋白分子机器的分子动力学进行模拟,得到复合物及其受体、配体运动的拓扑文件和坐标文件,并对其结合自由能进行计算;S30基于搭建的NRI模型及坐标文件对蛋白分子机器的运动轨迹进行预测,NRI模型中包括用于预测给定动态系统轨迹交互的编码器,及用于预测交互图中给定的动态系统轨迹的解码器;S40基于VR设备观察并记录蛋白分子机器的三维构造及运动轨迹。其结合分子动力学模拟和深度神经元网络,实现对蛋白分子机器的运动模式的精确模拟和预测。