本申请涉及一种统一细胞类型和状态特征的细胞相似性度量方法,它包括如下步骤:S1:选择特征基因;S2:计算细胞类型差异;S3:计算细胞状态差异;S4:计算细胞间的距离;S5:根据步骤S4中得到的细胞间的距离构建距离矩阵Wα和邻接矩阵Wfinal;S6:在邻接矩阵Wfinal上实施谱聚类。本发明能够有效处理表达矩阵中存在大量零表达的情形,有效减少单细胞数据固有噪声的影响,可应用于单细胞数据集的细胞鉴定和衡量肿瘤内异质性分析。
📄 2022105095322
📂 G16B50_30
👤 华东交通大学
📅 2022-05-10
本发明涉及蛋白质组学中的机器学习技术领域,具体涉及一种蛋白质谱图数据库快速增量构建方法,包括:新增数据基于gleams模型聚类;合并数据库和新增数据的聚类索引,通过faiss进行局部索引搜索;使用单点和批量插入的增量算法对数据进行动态的插入;去除重复并根据阈值进行簇数据合并;完成数据库的增量聚类。本发明主要解决了大型数据库的动态数据新增问题,同时缩短了谱图数据库聚类的时间,提高了数据库新增的性能。
📄 2020114169966
📂 G16B50_30
👤 重庆邮电大学
📅 2020-12-07