一种基于时序图网络的发酵过程软测量建模方法,属于发酵过程软测量技术领域。它包括以下步骤:(1)数据的获取和整合:获取不同工况下的青霉素发酵过程,对数据进行划分、收集和整合;(2)数据选择:对数据进行选择,去除冗余无用的数据并建立变量之间因果图;(3)建模训练:构建算法模型,并进行学习训练;(4)模型预测:使用训练后的算法模型进行预测,并给出预测结果。本发明提出了一种基于时序图网络的发酵过程软测量建模方法,提高了发酵过程关键产品质量的预测准确度;本方法利用图卷积网络和长短期记忆,在时间和空间维度上对数据进行提取,增加了模型的泛化性;本方法可以对不同发酵过程的关键产品质量进行精准测量。
📄 2022105251941
📂 G16B5_00
👤 浙江工业大学
📅 2022-05-15
一种基于水稻模型的稻瘟病传播机制模拟方法,利用虚拟的水稻模型,对稻瘟病发生发展进行研究,考虑多种影响稻瘟病菌的传播因素,例如温度、湿度会影响病菌的生存和繁殖情况;风对病菌孢子的影响,风的大小决定着孢子能否脱离母体进行扩散;风的方向决定病菌的扩散朝向,进而决定病害发展方向。本发明可视化展现了病毒随着时间推移在水稻群体间的传播趋势,为农业生产中病菌在植株间传播和扩散的路径研究提供了一种新的思路,也可为虚拟农业场景中如何逼真的建立病菌传播模型提供参考。
📄 2020102576641
📂 G16B5_00
👤 浙江工业大学
📅 2020-04-03
一种基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法,对蛋白质的序列信息和三维结构信息,各生成一个大小为L×1的蛋白质配体绑定残基的概率矩阵;将两个概率矩阵合并为一个大小为L×2的矩阵,并在其上使用滑动窗口,对蛋白质中的每个残基获取一个大小为17×2的特征矩阵M;其次,从蛋白质结构数据库PDB中收集已有ATP绑定残基标签的蛋白质信息,处理后构建训练样本集合,并利用支持向量机算法训练预测模型;再次,将待测蛋白质残基的特征矩阵M输入到训练好的模型中,输出预测结果;当预测的ATP绑定残基中有四个残基的Cα原子不在同一平面时,对预测为非ATP绑定的残基进行后处理。本发明计算代价低、预测精确性高。
📄 2021112544444
📂 G16B5_00
👤 浙江工业大学
📅 2021-10-27
本发明涉及一种基于深度学习的多层次生物分子网络构建与优化方法,属于人工智能领域,包括步骤一:搭建软硬件环境;步骤二:多层次生物分子网络数据收集及预处理,初步建立多层次生物分子网络;步骤三:收集生物各层次生物分子特征数据并进行相应特征编码,分为训练集和测试集;步骤四:根据网络优化目标及现有特征,构建网络优化模型;步骤五:使用多层次生物分子网络数据以及处理好的各层次生物分子特征数据进行训练,求解模型中各层的参数,达到预期效果停止训练并保存各层参数;步骤六:将训练好的神经网络模型进行部署,用于多层次生物分子网络优化。本发明解决了现有生物分子网络可拓展性不强,对复杂生物系统的描述不够深入的问题。
📄 2020100139359
📂 G16B5_00
👤 西南大学
📅 2020-01-07
本发明公开的一种基于布谷鸟搜索算法识别关键蛋白质的方法,发明属于生物信息技术领域,通过将蛋白质相互作用网络转化为无向图、对蛋白质相互作用网络进行去噪处理、获取蛋白质对应的基因表达数据、亚细胞定位信息、标准的蛋白质复合物信息以及GO注释信息、对纯化后的蛋白质相互作用网络的边和结点进行加权处理、产生鸟巢、产生布谷鸟、更新鸟巢适应值并产生关键蛋白质。本发明能准确地识别关键蛋白质;仿真实验结果表明,灵敏度、特异性、F测度、阳性预测值、阴性预测值以及正确率等指标较优;与其他现有识别方法相比,将布谷鸟搜索算法的优化特性与蛋白质相互作用网络的拓扑特征进行结合来识别关键蛋白质,提高了关键蛋白质的识别准确率。
📄 2018101120136
📂 G16B5_00
👤 陕西师范大学
📅 2018-02-05
本发明公开了一种基于病害流行机理的水稻纹枯病气象预测方法。目前水稻纹枯病预测的其它方法大多基于统计分析,仅能对病害年际发生情况进行整体预测,普遍无法给出关于病害发生发展过程的动态预测结果。本发明如下:一、建立病株率预测模型。二、确定模型中各调节系数。三、计算水稻纹枯病病株率的最终预测值。本发明以病害发生发展机理为基础,通过将气象数据与病害发生发展动力学方程组耦合构建时空动态的水稻纹枯病预警模型,能够克服传统病害预测经验主导、通用性差、时效性差等问题,为水稻纹枯病科学防控提供技术支撑。
📄 2020101095907
📂 G16B5_00
👤 杭州电子科技大学
📅 2020-02-22
本发明公开了一种超声扰动Piezo1蛋白质的分子动力学模拟分析方法,属于超声扰动领域。在分子动力学模拟中,通过对边界施加超声函数实现超声扰动,根据X轴的水密度验证超声成功加载;并建立通过细胞膜厚度、脂质蛋白质相互作用多角度阐释超声对细胞膜的影响,进一步研究细胞膜对蛋白质的影响的分析方法,得到超声对Piezo1结构的影响。本发明首次采用超声波加载粗粒化分子动力学模拟的方法来研究Piezo1机械敏感离子通道的构象变化,对未来超声治疗、声遗传学应用等领域提供重要的研究思路。
📄 2023100302918
📂 G16B5_00
👤 重庆邮电大学
📅 2023-01-10
本发明请求保护一种分子动力学视紫红质蛋白光循环模拟研究方法,以单聚体进行模拟研究,属于神经科学领域和分子动力学领域。具体步骤如下:(1)使用高斯软件对发色团C12‑C13=C14‑C15二面角进行扭转并进行角度调整;(2)将单聚体蛋白在CHARMM‑GUI软件嵌入细胞膜环境嵌入,对发色团小分子进行单独的力场设置(3)使用NAMD软件进行平衡态分子动力学模拟(4)对分子动力学轨迹进行分析,通过AMBER的cpptraj模块和VMD的tcl文件进行对应的分析。(5)使用拉伸分子动力学和伞形取样的方式计算自由能。该发明方法利用分子动力学研究视紫红质在光循环过程中的结构变化进一步实现光循环的仿真,对视紫红质在神经科学领域中的临床应用,脑功能研究以及工程学材料设计有着重要作用。
📄 2022101565634
📂 G16B5_00
👤 重庆邮电大学
📅 2022-02-21
本发明提供了一种蛋白分子机器的运动模式模拟方法,包括:S10获取蛋白分子机器结构数据文件;S20对蛋白分子机器的分子动力学进行模拟,得到复合物及其受体、配体运动的拓扑文件和坐标文件,并对其结合自由能进行计算;S30基于搭建的NRI模型及坐标文件对蛋白分子机器的运动轨迹进行预测,NRI模型中包括用于预测给定动态系统轨迹交互的编码器,及用于预测交互图中给定的动态系统轨迹的解码器;S40基于VR设备观察并记录蛋白分子机器的三维构造及运动轨迹。其结合分子动力学模拟和深度神经元网络,实现对蛋白分子机器的运动模式的精确模拟和预测。
📄 202211404471X
📂 G16B5_00
👤 江苏理工学院
📅 2022-11-10
本发明属于软组织变形模拟技术领域,具体涉及一种基于细胞神经网络的软组织形变仿真方法及装置。该方法包括构建三维细胞神经网络模型;对三维细胞神经网络模型施加外力,根据施加的外力求取三维细胞神经网络模型中细胞的细胞电流;根据细胞的细胞电流求取细胞的状态电压;根据细胞的状态电压求取细胞的位移;根据细胞的位移对三维细胞神经网络模型进行形变仿真。本发明具有较好的泛化性,能够在保持仿真实时性、仿真效果的同时实现快速建模。
📄 2023112962764
📂 G16B5_00
👤 南京信息工程大学
📅 2023-10-09
本公开提供了一种对枯草芽孢杆菌芽孢产量影响的试验设计方法及系统,涉及统计试验设计技术领域,包括获取试验的基本试验信息,确定试验响应与影响因素之间的关系模型;根据试验各因素取值范围以及各因素水平数,确定各因素的候选集合以及试验的设计空间;使用递归搜索策略,依次从当前试验设计中所有支撑点出发,在试验空间中递归搜索梯度较大的点,并将这些点加入试验设计当中,得到下一步第二试验设计;对第二试验设计中的设计点进行权重调整,得到第三试验设计,使用最优函数检查所述第三试验设计是否满足最优准则,若满足则当前试验设计即为最优试验设计。解决在计算时间有限的情况下可行解的质量低下的问题。
📄 2022115724227
📂 G16B5_00
👤 齐鲁工业大学(山东省科学院)
📅 2022-12-08
本发明公开了基于营养盐浓度的蓝藻生长模型的构建方法,(1)以不同浓度的营养盐培养某一种类蓝藻,初始时刻记为t0,记录t0时刻蓝藻的生物量N0和营养盐的浓度C0,培养过程中,在若干t时刻检测蓝藻的生物量N,待蓝藻生长经过了对数生长期进入平稳期后,停止培养记录;(2)将实验数据按t、C0、N0、N整理成4列,导入软件进行非线性拟合,在软件的非线性拟合功能中输入公式#imgabs0#通过拟合获取模型中的参数k、β、λ,从而构建基于营养盐浓度的蓝藻生长模型。本发明将蓝藻的表观出生率与营养盐的浓度关联,构建了基于营养盐浓度的蓝藻生长模型,模型仅需初始时的营养盐浓度和生物量即可预测蓝藻的生长过程,解决了目前“S”型曲线无法根据营养盐浓度模拟预测蓝藻生长过程的难题。
📄 2022114088385
📂 G16B5_00
👤 淮阴师范学院
📅 2022-11-10