摘要
本发明属于单核苷酸多态性上位检测技术领域,公开了一种多任务高阶SNP(single nucleotide polymorphism)上位检测方法、系统、存储介质、设备,所述多任务高阶SNP上位检测方法利用Plink软件从VCF文件中读取出PED,MAP格式数据,转换位二进制格式文件整理成样本矩阵;根据数据中SNP位点和样本量的大小,设置搜索算法参数;将SNP样本数据读入,开始准备第一阶段搜索;利用多任务、多和声记忆库和声搜索(harmony Search,HS)算法进行高阶SNP上位组合检测。本发明提出一种多任务和声搜索检测方法,采用多个和声记忆库,分别存放不同阶的SNP组合,多任务技术的运用,可以同时进行多个不同阶数的高阶SNP上位探测,促进种群内个体之间的相互学习,增强种群的多样性,进而提升全局搜索能力。
柿子坊 · 知识产权运营
柿子坊知识产权运营平台