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著 录 项 目:
专利/申请号: | CN201310670752.4 | 专利名称: | 基于多步双向DeBruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法 |
申请日: | 2013-12-10 | 申请/专利权人 | 深圳先进技术研究院 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 广东省深圳市南山区西丽大学城学苑大道1068号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | IPC分类号: | G06F19/22 分类检索 |
公开/公告日: | 2014-04-02 | 转让价格: | 【平台担保交易】 |
公开/公告号: | CN103699819A | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
浏览量: | 85 | 所属领域: | 数据服务 Ui专利转让搜索 |
摘 要:本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对分叉顶点的变长kmer进行构造和统计;步骤C:在所述多步双向De Bruijn图中基于变长kmer查询的顶点扩展。本发明只选取一些分叉的顶点构建非常少的一些变长kmer,然后对这些分叉顶点进行定向解耦,无需对每种kmer长度都去构建一个De Bruijn图,可以方便快速地解决所有长度小于序列长度的repeat,最大化contig的长度和质量。
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
解除代理委托书(需盖公章)一式两份(如专利通过代理机构申请) | 解除代理委托书(需签字)一式两份(如专利通过代理机构申请) | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
申请号 | 专利名称 | 发布日期 |
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