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专利名称:
双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法
申请号:
2012105870596
转让价格:面议
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法律状态:已下证 类型:发明 关键词:
Ui
相似专利
发布日:2024/10/31
摘要: 本发明涉及一种双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,包括压缩存储步骤,和deBruijn图构造步骤。本发明提供的双向多步deBruijn图的压缩存储和构造方法,(1)结合DNA序列互补双螺旋结构的特点,对de Bruijn图结构进行结构优化,使用双向多步de Bruijn图,可以将需要存储的图的节点减半;(2)针对序列组装的原始de Bruijn图规模异常庞大,对内存造成存储压力等问题,使用双向多步de Bruijn图的压缩存储技术,使得存储双向多步de Bruijn图的内存消耗控制在参考序列大小的100倍以内;(3)构造双向多步de Bruijn图,可将DNA序列组装问题分解为边融合子问题,更适合并行计算。
专利名称:
基于多步双向DeBruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法
申请号:
2013106707524
转让价格:面议
收藏
法律状态:已下证 类型:发明 关键词:
数据服务 Ui
相似专利
发布日:2024/10/31
摘要: 本发明涉及基因测序技术领域,提供了一种基于多步双向De Bruijn图的变长kmer查询的顶点扩展方法,包括:步骤A:读取测序数据源文件,构造多步双向De Bruijn图;步骤B:在所述多步双向De Bruijn图中对分叉顶点的变长kmer进行构造和统计;步骤C:在所述多步双向De Bruijn图中基于变长kmer查询的顶点扩展。本发明只选取一些分叉的顶点构建非常少的一些变长kmer,然后对这些分叉顶点进行定向解耦,无需对每种kmer长度都去构建一个De Bruijn图,可以方便快速地解决所有长度小于序列长度的repeat,最大化contig的长度和质量。
专利名称:
一种Ag/UiO-66-NH2复合材料及其制备方法和应用
申请号:
2017112021680
转让价格:面议
收藏
法律状态:已下证 类型:发明 关键词:
复合材料 Ui
相似专利
发布日:2025/02/18
摘要: 本发明涉及一种Ag/UiO‑66‑NH2复合材料及其制备方法和应用。采用的技术方案是:将硝酸银的乙腈溶液缓慢滴加到UIO‑66‑NH2晶体中,得到Ag+/UiO‑66‑NH2;于Ag+/UiO‑66‑NH2中,加入饱和的硼氢化钠的乙醇溶液,得到Ag/UiO‑66‑NH2复合材料。本发明合成的Ag/UiO‑66‑NH2复合材料对环氧化反应中苯乙烯具有高效的催化活性。
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