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摘 要:一种基于Rosetta局部增强的群体蛋白质结构预测方法,首先,将结构预测中的整个算法搜索过程分为四个阶段,对每个阶段设置片段长度进行片段组装,并选用不同的能量函数来衡量构象个体的质量;然后,基于二级结构信息,采用不同的变异策略利用loop区域信息来生成测试构象,并通过随机交换loop区域信息实现交叉过程,保持种群多样性,同时对每个阶段的测试构象和目标构象执行Rosetta局部增强;最后,提取构象的特征向量来衡量各构象个体的多样性,从而以能量函数为主要衡量指标,并以多样性为辅助衡量指标来指导构象种群更新。本发明搜索能力强、能量保持种群多样性、预测精度高。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201611176255.9 | 专利名称: | 一种基于Rosetta局部增强的群体蛋白质结构预测方法 |
申请日: | 2016-12-19 | 申请/专利权人 | 浙江工业大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B15/30搜分类 SE R 港口 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |