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摘 要:一种基于简约空间抽象凸下界估计的蛋白质构象优化方法,包括以下步骤:根据粗粒度能量模型,以Rosetta Score3为优化目标函数,将能量计算模型转换为二面角优化空间能量模型;通过特征向量提取,将高维二面角优化问题转换为实际可操作的笛卡儿空间优化问题;基于Karmarker射影变换,将笛卡儿空间能量模型转换成单位单纯形约束下的非线性优化问题,如此构建抽象凸下界支撑面,并进行更新;结合片段组装和Monte Carlo算法获得一系列亚稳态构象;最后,通过Rosetta服务器提供的Refinement服务获得高分辨率的蛋白质构象。本发明采样效率较高、复杂度较低、预测精度较高。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201410686664.8 | 专利名称: | 一种基于简约空间抽象凸下界估计的蛋白质构象优化方法 |
申请日: | 2014-11-25 | 申请/专利权人 | 浙江工业大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 浙江省杭州市下城区朝晖六区潮王路18号浙江工业大学 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G06F19/16搜分类 空间 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2017/06/30 | 授权 | |
2015/07/22 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G06F 19/16 专利申请号: 201410686664.8 申请日: 2014.11.25 |
2015/06/24 | 公开 |