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摘 要:本发明公开了基于stacking集成的RNA中N6‑甲基腺苷修饰位点预测方法,涉及系统生物学领域。通过6种特征提取方法提取酿酒酵母、智人和拟南芥3个物种的RNA序列特征,通过特征融合得到原始数据集的初始特征空间;利用弹性网络对其进行降维,剔除冗余、噪声特征,保留对模型分类相关的重要特征,得到最佳特征集合;把最优特征子集以及所对应的类别标签输入到stacking集成中进行模型训练,并结合评价指标评估模型的预测性能,得到预测模型;将测试集中待预测的RNA序列,输入至预测模型中,预测m6A位点并输出。此模型在测试集上的预测准确率分别达到92.30%和87.06%,在跨物种预测方面具有很好的发展潜力,可成为鉴定m6A位点的有用工具。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202010021486.2 | 专利名称: | 基于stacking集成的RNA中N6-甲基腺苷修饰位点预测方法 |
申请日: | 2020-01-09 | 申请/专利权人 | 青岛科技大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 山东省青岛市崂山区松岭路99号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B15/30搜分类 C R 港口搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
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卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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日期 | 法律信息 | 备注 |