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摘 要:本发明提供一种基于结构拓扑的G蛋白偶联受体跨膜螺旋三维结构的预测方法,包括:(1)构建跨膜螺旋的结构拓扑模型:先构建G蛋白偶联受体的7个跨膜螺旋的几何结构拓扑模型;(2)预测所述跨膜螺旋的结构拓扑模型,分为四个阶段:(21)第一阶段为识别跨膜螺旋区域;(22)第二阶段为优化跨膜螺旋间的相对位置;(23)第三阶段为优化每个螺旋在膜内的自转朝向;(24)第四阶段为优化每个螺旋与膜的倾斜角度;(3)Loop重建:用Loop片段插入连结7个螺旋,最后将整体结构进行小幅度的优化。本发明方法针对跨膜螺旋的空间结构特点,建立兼顾保守性与多样性的结构拓扑模型,并利用该模型形成了四阶段的结构优化方法,试图获得采样广度与深度的平衡。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201310381447.3 | 专利名称: | 一种基于结构拓扑的G蛋白偶联受体跨膜螺旋三维结构的预测方法 |
申请日: | 2013-08-28 | 申请/专利权人 | 苏州大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 江苏省苏州市工业园区仁爱路199号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G06F19/16搜分类 三维 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 2013-11-27 | 转让价格: | 面议 |
公开/公告号: | CN103413068A | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2016/11/30 | 授权 | |
2013/12/18 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G06F 19/16 专利申请号: 201310381447.3 申请日: 2013.08.28 |
2013/11/27 | 公开 |