发明专利已授权

基于CPU-GPU异构复合式并行计算框架的密码子偏差系数模型方法

📄 申请号：CN201710332575.7 📄 发布日：2026/08/04

著录项目信息

申请日

2017-05-12

公开号

CN107168795B

公开日

2019-05-03

申请人

西南大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G06F9_50

IPC 分类号

G06F9_50 , H04L29_08 ,

技术画像

所属领域

生物信息学生物信息学并行计算密码子使用偏好分析

应用场景

基因序列分析, 基因组学研究, 密码子优化, 生物医药研发, 生命科学研究

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摘要

本发明提供了一种基于CPU‑GPU异构复合式并行计算框架的密码子偏差系数实现方法，包括：在刀片机上建立集群，每台刀片机作为一个节点；并将主节点同时设置为主节点和从节点；搭建CUDA框架环境，并进行网络配置；对提交的批量作业目录进行预处理，拟合输出包含各个待处理任务文件实际HDFS存储位置的任务清单到指定的目录；定义对任务清单的划分规则，并发送到节点中进行处理；获取到单个任务文件的HDFS路径，将其下载到本地节点后，整理为命令请求；并将文件内容和命令请求发送到GPU服务器上；在监控到GPU服务器端计算完成后，将输出文件下载到本地，并上传至HDFS。本发明在批量作业提交情况下实现作业划分、并行处理以及内存计算，提高了密码子偏性算法的效率。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

一种管道清淤堵仿生蛇形机器人

当前第 / 件

一种NbSe2电极材料的制备方法及其产品和应用

同领域国内专利 · IPC: (G06F9_50)

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议价

不含过户费

📋 交易方式： 委托待转让 📌 交易状态：在售 👁️ 浏览次数：9 ❤️ 收藏人数：93 📋 项目申报： 未申报

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