发明专利已授权

一种基因序列比对方法及系统

Name: 一种基因序列比对方法及系统
Brand: 山东师范大学
SKU: 2022100443841
Availability: InStock

📄 申请号：CN202210044384.1 📄 发布日：2026/07/23

著录项目信息

申请日

2022-01-14

公开号

CN114550827B

公开日

2022-11-22

申请人

山东师范大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B30_10

IPC 分类号

G16B30_10 , G06N3_00 ,

技术画像

所属领域

基因序列比对基因序列比对生物信息学序列分析算法

应用场景

基因组学研究, 临床基因检测, 遗传病筛查, 病原微生物检测, 药物研发

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摘要

本发明提供了一种基因序列比对方法及系统，包括：将隐马尔可夫模型的参数编码为蜜源，对于每条基因序列，采用所有蜜源对应的隐马尔可夫模型，得到每条基因序列对应的多种隐状态序列；判断是否满足终止条件，若满足，对适应度值最大的蜜源对应的隐马尔可夫模型得到的所有基因序列的隐状态序列进行两两比对，得到与每条基因序列最相似的基因序列；否则，基于每个蜜源的适应度值，将所有蜜源分为多个种群，在不同种群之间进行差异性学习，来优化隐马尔可夫模型的参数，直到满足终止条件。增强了隐马尔可夫模型的参数搜索的随机性，避免求解陷入局部最优，提高了多序列比对时解的精度。

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……

图1

图2

图3

法律状态时间线

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当前第 / 件

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