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一种基于接触概率辅助的蛋白质ATP对接方法，首先，使用ATPbind等五个蛋白质绑定残基预测服务器预测出蛋白质‑ATP的绑定残基信息，并使用投票法选择出现次数多的残基作为绑定残基，提高绑定残基的精确性；其次，从PDB数据库中提取特定类型绑定残基与ATP各原子的接触概率矩阵，作为能量函数对生成的构象进行打分，提升对接精度；最后，通过使用改进的差分进化算法搜索最优个体，提高计算效率。本发明提供一种计算代价低、预测精确性较高的基于接触概率辅助的蛋白质ATP对接方法。

本发明公开了一种评估基因组组装完整度方法及装置，根据测序报告确定测序reads的长度和测序错误率；在基因组序列中的随机位置上产生模拟reads；根据测序错误率在模拟产生的reads上进行错误性碱基替换；对实际和模拟产生的reads逐个碱基进行一定长度短片段kmer的抽取，并比较其反向互补配对序列，取在字母表排列在前的kmer作为序列标识；根据不同标识kmer的出现频次分布，计算所有kmer的频次深度分布；根据模拟测序数据产生的kmer频次深度分布与实际测序数据产生的kmer频次深度分布来评估基因组组装完整度。本发明整体设计不依赖于其他数据库，采用简单可行的手段对基因组进行科学合理的完整性评估。