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摘 要:本发明公开了基于深度森林的蛋白质‑蛋白质相互作用预测方法,属于生物信息技术领域。所述方法融合伪氨基酸组成、自相关描述符、互信息描述符、组成、分布和转化描述符、氨基酸组成位置特异性得分矩阵和二肽组成位置特异性得分矩阵将蛋白质序列转化为数值向量,融合蛋白质对的序列信息、物理化学性质信息和进化信息作为样本的初始特征;使用弹性网进行特征选择,剔除冗余和不相关的特征;将融合后的最优特征向量输入到构建的多粒度级联深度森林中,预测蛋白质‑蛋白质相互作用。本发明简单有效,深度森林能够表征蛋白质对的高水平特征信息,在训练集和测试集上的结果明显优于其它预测方法,可以为药物靶点预测和人类疾病治疗提供一定借鉴。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202010021475.4 | 专利名称: | 基于深度森林的蛋白质-蛋白质相互作用预测方法 |
申请日: | 2020-01-09 | 申请/专利权人 | 青岛科技大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 山东省青岛市崂山区松岭路99号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B20/00搜分类 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 2023-06-13 | 转让价格: | 面议 |
公开/公告号: | CN111210871B | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2023/06/13 | 授权 | |
2020/06/23 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 20/00 专利申请号: 202010021475.4 申请日: 2020.01.09 |
2020/05/29 | 公开 |