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摘 要:本发明公开了一种基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法,对于待预测的细胞系收集蛋白质数据和样本DNA序列,在样本DNA序列中确定4个关键位点及对应的CTCF motif数据,根据所有样本DNA序列的CTCF motif数据训练Word2Vec模型和Doc2Vec模型,对于每个样本DNA序列分别提取其序列特征和蛋白质特征,然后拼接得到该样本DNA序列的特征向量,将样本DNA序列的特征向量作为输入、将CTCF介导染色质环是否存在的样本标签作为期望输出,对构建的CTCF介导染色质环预测模型进行训练,当需要对待预测的细胞系某个DNA序列中两个位点之前是否存在CTCF介导染色质环进行预测时,采用相同方法得到特征向量,输入训练好的CTCF介导染色质环预测模型得到预测结果。本发明可有效提高CTCF介导染色质环的预测准确率。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202210086044.5 | 专利名称: | 基于多特征的CTCF介导染色质环预测方法 |
申请日: | 2022-01-25 | 申请/专利权人 | 云南大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 云南省昆明市翠湖北路2号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B20/30搜分类 纺织印染 C CT F搜索 |
公开/公告日: | 2022-12-23 | 转让价格: | 面议 |
公开/公告号: | CN114550817B | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
解除代理委托书(需盖公章)一式两份(如专利通过代理机构申请) | 解除代理委托书(需签字)一式两份(如专利通过代理机构申请) | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2022/12/23 | 授权 | |
2022/06/14 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 20/30 专利申请号: 202210086044.5 申请日: 2022.01.25 |
2022/05/27 | 公开 |