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摘 要:基于深度学习的nanopore测序数据碱基识别方法,涉及生物信息学领域,针对现有技术中nanopore测序准确率低的问题,一:下载包括肺杆菌、肠杆菌、变形杆菌在内的50组nanopore原始数据作为训练集;二:对50组原始数据进行碱基识别,得到碱基序列;三:获取准确率在99%以上的Illumina测序序列,并以准确率在99%以上的Illumina测序序列作为参考基因组,以参考基因组作为ground truth并使用Tombo算法对碱基序列进行校正;四:使用Re‑squiggle方法将校正后的碱基序列转换为对应的电信号数据,然后将电信号数据进行标记;五:利用标记后的电信号数据以及原始数据训练神经网络,并利用训练好的神经网络进行碱基识别。本申请实现了对nanopore测序数据碱基序列高准确的识别。
著 录 项:
专利/申请号: | CN202111172443.5 | 专利名称: | 基于深度学习的nanopore测序数据碱基识别方法 |
申请日: | 2021-10-08 | 申请/专利权人 | 东北林业大学,电子科技大学长三角研究院(衢州) |
专利类型: | 发明 | 地址: | 黑龙江省哈尔滨市香坊区和兴路26号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G16B30/00搜分类 深度学习 R P 港口搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2022/05/17 | 授权 | |
2022/01/21 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G16B 30/00 专利申请号: 202111172443.5 申请日: 2021.10.08 |
2021/12/31 | 公开 |