发明专利 已授权

一种基于序列特征的植物长链非编码RNA预测方法

📄 申请号:CN202210570828.5 📄 发布日:2026/08/26

著录项目信息

申请日
2022-05-24
公开号
CN114882953B
公开日
2024-12-13
申请人
南京邮电大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号

技术画像

应用场景

植物基因功能研究, 作物分子育种, 基因表达调控分析, 生物信息学服务, 分子生物学研究

摘要

一种基于序列特征的植物长链非编码RNA预测方法,包括正负数据集构建去冗余、序列k‑mer频率特征提取、特征融合与选择以及分类器对比,正负数据集的构建去冗余旨在消除序列相似性对预测结果造成的影响,序列特征提取实现了对基因序列k‑mer特征的提取,特征融合在序列k‑mer特征提取的基础上加入序列长度特征和序列GC含量特征后将这三类特征进行融合,接着使用卡方检验进行最优特征选择,最后运用梯度提升决策树算法解决植物lncRNA的识别分类问题。本发明深入挖掘了基因序列特征,有效的融合这些特征且加以选择,为如何从大量的转录本中准确地识别出植物lncRNA这一问题提供了可行的方法。
权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

同领域国内专利 · IPC: (G16B40_20)

G16B40_00 G16B40_20 G16B40_30 覆盖3个领域
议价
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📋 交易方式: 委托待转让 📌 交易状态: 在售 👁️ 浏览次数:3 ❤️ 收藏人数:93 📋 项目申报: 未申报

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