发明专利已授权

一种面向药物虚拟筛选的多线程协作的GPU加速方法

📄 申请号：CN202210479528.6 📄 发布日：2026/08/26

著录项目信息

申请日

2022-05-05

公开号

CN114860441A

公开日

2022-08-05

申请人

南京邮电大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G06F9_50

IPC 分类号

G06F9_50

技术画像

所属领域

GPU并行计算 GPU并行计算多线程协作药物虚拟筛选

应用场景

药物虚拟筛选, 新药研发, 分子对接, 高通量筛选, 计算机辅助药物设计

AI 智能推荐 · 同申请人专利 · 搜索相似专利

摘要

本发明涉及一种面向药物虚拟筛选的多线程协作的GPU加速方法及实现，该方法通过增加初始随机配体构象的数目来减少蒙特卡罗的迭代局部搜索方法中的搜索步数。利用OpenCL实现CPU和GPU异构并行结构以此达到更高水平的并行和加速能力。该方法还通过构造GPU中全局内存的结构来解决OpenCL中无法实现八叉树的问题。现代药物筛选需要面对海量的化合物数据，在实际分子对接过程中，有可能在对接之前事先不知道靶区，此时要将配体对接到蛋白质靶标的整个表面，找到配体和受体最佳结合模式，这个过程称为盲对接，常用的的对接软件很难满足盲对接的要求。采用本发明的方法，可以在保证在盲对接的情况下，不损失对接精度的同时大幅加快分子对接和虚拟筛选的速度，满足大型化合物数据库分子对接的实际需求。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

一种基于值流分析的Golang程序高效过程间逃逸分析方法

当前第 / 件

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议价

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