发明专利已授权

基于GPU加速的分子对接方法和装置

📄 申请号：CN202210449861.2 📄 发布日：2026/08/26

著录项目信息

申请日

2022-04-26

公开号

CN114783545A

公开日

2022-07-22

申请人

南京邮电大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16C20_50

IPC 分类号

G16C20_50 , G16C20_90 , G16C20_70 , G16C10_00 , G06F9_50 ,

技术画像

所属领域

计算机辅助药物设计计算机辅助药物设计分子模拟并行计算

应用场景

药物筛选, 虚拟筛选, 药物设计, 分子动力学模拟, 生物信息学

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摘要

本发明公开了一种基于GPU加速的分子对接方法及装置，包括：CPU端进行数据准备以及设置OpenCL环境，其中数据准备包括对接盒子及对接盒子的参数准备，随后将数据传输到GPU端；GPU端计算对接盒子中格点处原子和受体的原子的相互作用力并生成网格缓存表；CPU端生成配体的多个随机分子构象并传到GPU端，GPU端利用蒙特卡罗的迭代局部搜索算法优化随机分子构象并打分，得到构象并传输至回CPU端；CPU端将构象进行优化和排序；依次对配体库中所有配体进行上述优化步骤；使用打分函数ΔvinaRF20对CPU端中的分子构象进行打分并排序。本发明通过ΔvinaRF20对构象重新打分并排序，提高了输出构象的准确性；提出了一种基于OpenCL的AutoDock Vina异构并行加速结构，降低了对接时间和药物研发成本。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

一种智能反射面辅助认知无线电系统资源分配优化方法

当前第 / 件

一种具有内参信号的比率型生物传感器及制备方法

同领域国内专利 · IPC: (G16C20_50)

G16C20_10 G16C20_20 G16C20_30 G16C20_40 G16C20_50 G16C20_60 G16C20_64 G16C20_70 G16C20_80 G16C20_90 覆盖10个领域

议价

不含过户费

📋 交易方式： 委托待转让 📌 交易状态：在售 👁️ 浏览次数：3 ❤️ 收藏人数：93 📋 项目申报： 未申报

资金托管权属尽调包过户

🏢 淄博智来知识产权服务有限公司

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