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发明专利
已授权
一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法
📄 申请号:CN202610055671.0
📄 发布日:2026/08/13
著录项目信息
申请日
2026-01-16
公开号
CN121528309B
公开日
2026-03-20
申请人
烟台大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
G16B30_10
IPC 分类号
G16B30_10
,
G16B20_30
,
技术画像
所属领域
生物信息学算法
生物信息学算法
基因序列比对
泛基因组分析
应用场景
基因测序数据分析, 基因组组装, 变异检测, 比较基因组学, 精准医学
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摘要
本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法;本发明方法首先基于分频降权的加权syncmer采样对参考泛基因组图的segment进行处理,过滤高频冗余k‑mer、保留高特异性k‑mer,再构建哈希索引实现查询序列k‑mer的快速匹配,并生成候选锚点数组,大幅减少错误匹配、提升比对效率;然后,基于泛基因组图的拓扑信息,通过回溯计算筛选最佳线性链并进一步扩展为最佳图链,分层筛选策略降低了复杂图结构的搜索复杂度;最后,整合候选泛基因组图链集合输出比对结果,保障了结果的高精度与完整性,能够实现了对复杂拓扑结构泛基因组图的高效准确比对。
权利要求书 (12项)
说明书
附图
……
……
图1
图2
图3
法律状态时间线
一种基于网络增速的虚假消息识别方法及其装置
当前第 / 件
一种单倍型感知的序列到图比对方法、系统、装置、介质
同领域国内专利 · IPC: (G16B30_10)
G16B30_00
G16B30_10
G16B30_20
覆盖
3
个领域
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议价
不含过户费
委托平台代购
📋 交易方式:
委托待转让
📌 交易状态:
在售
👁️ 浏览次数:17
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📋 项目申报:
未申报
资金托管
权属尽调
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