发明专利 已授权

一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法

📄 申请号:CN202610055671.0 📄 发布日:2026/08/13

著录项目信息

申请日
2026-01-16
公开号
CN121528309B
公开日
2026-03-20
申请人
烟台大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

基因测序数据分析, 基因组组装, 变异检测, 比较基因组学, 精准医学

摘要

本发明涉及基因序列比对技术领域,具体为一种基于加权syncmer的泛基因组长读长比对方法;本发明方法首先基于分频降权的加权syncmer采样对参考泛基因组图的segment进行处理,过滤高频冗余k‑mer、保留高特异性k‑mer,再构建哈希索引实现查询序列k‑mer的快速匹配,并生成候选锚点数组,大幅减少错误匹配、提升比对效率;然后,基于泛基因组图的拓扑信息,通过回溯计算筛选最佳线性链并进一步扩展为最佳图链,分层筛选策略降低了复杂图结构的搜索复杂度;最后,整合候选泛基因组图链集合输出比对结果,保障了结果的高精度与完整性,能够实现了对复杂拓扑结构泛基因组图的高效准确比对。
权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

同领域国内专利 · IPC: (G16B30_10)

G16B30_00 G16B30_10 G16B30_20 覆盖3个领域
议价
不含过户费

📋 交易方式: 委托待转让 📌 交易状态: 在售 👁️ 浏览次数:17 ❤️ 收藏人数:93 📋 项目申报: 未申报

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