摘要
一种基于多样性指标的群体蛋白质构象空间优化方法,首先,利用Rosetta第一阶段进行片段组装生成初始种群,并利用Rosetta第二阶段进行片段组装生成新种群;然后,针对随机选取的Loop区域,对构象进行Loop交换,从而实现种群重组;其次,基于Loop区域,对每个构象进行变异操作,并将变异生成的所有新个体与当前种群进行合并,并提取构象的USR特性信息建立多样性指标,基于该指标和能量对整个种群进行更新操作;最后,分别利用Rosetta第三和第四阶段对整个种群进行进一步优化,从而得到最终预测结果。本发明采样效率较高、多样性较好、复杂度较低及预测精度较高。