发明专利 已授权

基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法

📄 申请号:CN202111254444.4 📄 发布日:2026/08/04

著录项目信息

申请日
2021-10-27
公开号
CN114121143B
公开日
2025-05-09
申请人
浙江工业大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

药物研发, 蛋白质功能预测, 生物医学研究, 靶点发现, 分子设计

摘要

一种基于后处理方式的蛋白质与ATP绑定残基预测方法,对蛋白质的序列信息和三维结构信息,各生成一个大小为L×1的蛋白质配体绑定残基的概率矩阵;将两个概率矩阵合并为一个大小为L×2的矩阵,并在其上使用滑动窗口,对蛋白质中的每个残基获取一个大小为17×2的特征矩阵M;其次,从蛋白质结构数据库PDB中收集已有ATP绑定残基标签的蛋白质信息,处理后构建训练样本集合,并利用支持向量机算法训练预测模型;再次,将待测蛋白质残基的特征矩阵M输入到训练好的模型中,输出预测结果;当预测的ATP绑定残基中有四个残基的Cα原子不在同一平面时,对预测为非ATP绑定的残基进行后处理。本发明计算代价低、预测精确性高。
权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

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