发明专利 已授权

一种基于TM-align的多域蛋白模板搜索方法

📄 申请号:CN201710382371.4 📄 发布日:2026/08/04

著录项目信息

申请日
2017-05-26
公开号
CN107273713B
公开日
2020-06-02
申请人
浙江工业大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

蛋白质结构预测, 蛋白质功能注释, 药物靶点发现, 结构生物学研究

摘要

一种基于TM‑align的多域蛋白模板搜索方法,首先,从蛋白质库中提取多域蛋白建立多域蛋白质库;然后,基于蛋白质结构比对工具TM‑align计算模板蛋白对于每个单域蛋白的局部比对得分,并取最高值为模板的局部得分;其次,选出局部得分最高的前500个模板进行全局评价,按照单域蛋白的比对顺序分多种情况进行评价,在评价过程中,模板中的各残基禁止重复比对,并且遵循查询蛋白中的各域的实际顺序比对,选出各种比对情况中全局比对得分最高值为模板的最终得分;最后,根据最终得分对进行排名,选择最终得分最高的模板为最终模板。本发明可以较快得到最佳模板,且可以获取域之间方向信息,模板质量较高。
权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

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