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双向三核苷酸位置特异性偏好和点联合互信息DNA/RNA序列编码方法

Name: 双向三核苷酸位置特异性偏好和点联合互信息DNA/RNA序列编码方法
Brand: 陕西师范大学
SKU: 2020112361082
Availability: InStock

📄 申请号：CN202011236108.2 📄 发布日：2026/07/23

著录项目信息

申请日

2020-11-09

公开号

CN112365924B

公开日

2023-03-21

申请人

陕西师范大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B30_00

IPC 分类号

G16B30_00 , G16B40_20 , G16B20_30 ,

技术画像

所属领域

编码方法生物信息学基因序列分析序列编码编码方法

应用场景

基因组学研究, 基因序列特征提取, 生物信息分析, 疾病标志物发现, 药物研发

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摘要

一种双向三核苷酸位置特异性偏好和点联合互信息DNA/RNA序列编码方法，由建立DNA/RNA序列核苷酸位置特异性偏好矩阵、建立DNA/RNA序列双向二核苷酸位置特异性偏好矩阵、建立DNA/RNA序列双向三核苷酸位置特异性偏好矩阵、确定DNA/RNA序列核苷酸的点联合互信息值、特征组合、DNA/RNA序列样本编码步骤组成。为了从DNA/RNA序列数据中提取更多三核苷酸的位置信息，引入参数β表示当前核苷酸与其前向或后向连续二核苷酸之间的距离，将β不同取值的数值特征向量组合为全局高维数值特征向量，在用于DNA的4mC甲基化位点和RNA的m6A甲基化位点识别中具有非常好的性能。本发明得到的DNA/RNA数值特征数据具有分类信息多、特征间冗余度低、训练的模型识别准确率高等优点，可用于DNA/RNA序列的编码。

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权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

20230321

✅ 授权

20210305

?? 实质审查的生效：

20210212

📄 公开

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