发明专利已授权

评估基因组组装完整度方法及装置

Name: 评估基因组组装完整度方法及装置
Brand: 广东联方生物科技有限公司
SKU: 2022104232657
Availability: InStock

📄 申请号：CN202210423265.7 📄 发布日：2026/07/23

著录项目信息

申请日

2022-04-21

公开号

CN114724632A

公开日

2022-07-08

申请人

广东联方生物科技有限公司

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B30_20

IPC 分类号

G16B30_20 , G16B35_00 ,

技术画像

所属领域

生物信息学生物信息学基因组测序序列分析

应用场景

基因组研究, 医学诊断, 生物育种, 病原微生物检测, 个性化医疗

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摘要

本发明公开了一种评估基因组组装完整度方法及装置，根据测序报告确定测序reads的长度和测序错误率；在基因组序列中的随机位置上产生模拟reads；根据测序错误率在模拟产生的reads上进行错误性碱基替换；对实际和模拟产生的reads逐个碱基进行一定长度短片段kmer的抽取，并比较其反向互补配对序列，取在字母表排列在前的kmer作为序列标识；根据不同标识kmer的出现频次分布，计算所有kmer的频次深度分布；根据模拟测序数据产生的kmer频次深度分布与实际测序数据产生的kmer频次深度分布来评估基因组组装完整度。本发明整体设计不依赖于其他数据库，采用简单可行的手段对基因组进行科学合理的完整性评估。

常见问题

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权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

20250912

?? 专利权的转移：

20230321

✅ 授权

20220726

?? 实质审查的生效：

20220708

📄 公开

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议价

不含过户费

📋 交易方式： 委托待转让 📌 交易状态：在售 👁️ 浏览次数：52 ❤️ 收藏人数：93 📋 项目申报： 未申报

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🏢 淄博智来知识产权服务有限公司

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