发明专利 已授权

基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置

📄 申请号:CN202210752688.3 📄 发布日:2026/06/30

著录项目信息

申请日
2022-06-28
公开号
CN115171786A
公开日
2022-10-11
申请人
江苏理工学院
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

蛋白质组学, 生物医药研发, 质谱数据分析

摘要

本发明提供一种基于deBruijn图的肽序列组装方法和装置,所述方法包括以下步骤:获取轻重链序列数据,并使用所述轻重链序列数据创建序列比对数据库;将肽序列测试数据进行k‑mer处理,得到k‑mer序列集合;将所述k‑mer序列集合与所述序列比对数据库进行比对,得到比对得分;若所述k‑mer序列集合中是轻重链混合数据,则将所述比对得分分为轻链和重链两类,分别构建deBruijn图,若所述k‑mer序列集合是轻链或者重链数据,则直接构建deBruijn图;在所述deBruijn图中进行序列组装,得到组装好的肽序列。本发明能够将肽序列片段在区分轻重链的条件下进行肽序列组装,组装效率有了很大的提高,组装结果有效可靠。
权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

同领域国内专利 · IPC: (G16B30_10)

G16B30_00 G16B30_10 G16B30_20 覆盖3个领域
议价
不含过户费

📋 交易方式: 委托待转让 📌 交易状态: 在售 👁️ 浏览次数:71 ❤️ 收藏人数:93 📋 项目申报: 未申报

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