发明专利已授权

基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法

📄 申请号：CN202310765180.1 📄 发布日：2026/05/07

著录项目信息

申请日

2023-06-27

公开号

CN116504314A

公开日

2023-07-28

申请人

华东交通大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B30_00

IPC 分类号

G16B30_00 , G16B40_00 ,

技术画像

所属领域

生物信息学生物信息学基因调控网络细胞分化分析

应用场景

基因功能研究, 疾病机制研究, 药物靶点发现, 干细胞分化研究, 精准医疗

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摘要

本发明提出一种基于细胞动态分化的基因调控网络构建方法，该方法包括，获取单细胞转录组测序数据并进行预处理，再利用Slingshot进行推断，得到包含细胞注释信息和拟时间信息的表达矩阵；根据表达矩阵中拟时间信息的密度计算两种细胞状态之间的交点，以交点为基准，将所有细胞划分成多个窗口；在每个窗口中构建细胞类型特异性基因调控网络；构建参考网络，将参考网络作为参考信息来校准细胞类型特异性基因调控网络。本发明将拟时间信息和细胞类型结合，并且考虑了细胞密度沿拟时间的分布状况，有助于从细胞动态分化的角度构建细胞类型特异性的基因调控网络，使得所构建的基因调控网络更准确。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

通过增强LIBS信号检测水溶液中重金属元素的系统及方法

当前第 / 件

行人重识别方法、系统、可读存储介质及计算机设备

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