发明专利 已授权

一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法

📄 申请号:CN201910484769.8 📄 发布日:2026/07/23

著录项目信息

申请日
2019-06-05
公开号
CN110211640A
公开日
2019-09-06
申请人
南通大学
法律状态
已下证
专利类型
发明
主分类号
IPC 分类号

技术画像

应用场景

疾病易感基因挖掘, 精准医疗, 基因组学研究, 药物靶点发现, 生物医学大数据分析

摘要

本发明提供一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法,包括如下步骤:步骤一、基于背景控制的主效+上位性检测算法研究,采用两阶段策略:第一阶段,在所有主效和上位性效应中,剔除无关变量,保留较少的变量;第二阶段,将通过第一阶段筛选的变量放入模型中进行最终确定变量选择方法;步骤二、建立基于GPU并行计算的加速算法,得到MRMLM-GPU新方法;步骤三、MRMLM-GPU新方法的性能分析。本发明是在MRMLM算法上进行背景控制的上位性拓展以及GPU加速改进,MRMLM算法上位性初筛阶段,SNP以及SNP对之间相互独立,PyCUDA提供了更为简单的编程方式实现GPU的并行。本发明为预测人类疾病的互作基因提供了可行的新方法。

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权利要求书 (12项) 说明书 附图

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图1
图2
图3

法律状态时间线

同领域国内专利 · IPC: (G16B40_00)

G16B40_00 G16B40_20 G16B40_30 覆盖3个领域
议价
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📋 交易方式: 委托待转让 📌 交易状态: 在售 👁️ 浏览次数:48 ❤️ 收藏人数:93 📋 项目申报: 未申报

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