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| 专利/申请号: | CN201910484769.8 | 专利名称: | 一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法 |
| 申请日: | 2019-06-05 | 申请/专利权人 | 南通大学 |
| 专利类型: | 发明 | 地址: | 江苏省南通市崇川区啬园路9号 |
| 专利状态: | 已下证 查询审查信息 | IPC分类号: | G16B40/00 分类检索 |
| 公开/公告日: | 2019-09-06 | 转让价格: | 【平台担保交易】 |
| 公开/公告号: | CN110211640A | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
| 浏览量: | 8 | 所属领域: | 基因工程专利转让搜索 |
应用场景:复杂疾病(如癌症、糖尿病)的基因互作研究;高通量基因数据分析;生物医学大数据处理
摘 要:本发明提供一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法,包括如下步骤:步骤一、基于背景控制的主效+上位性检测算法研究,采用两阶段策略:第一阶段,在所有主效和上位性效应中,剔除无关变量,保留较少的变量;第二阶段,将通过第一阶段筛选的变量放入模型中进行最终确定变量选择方法;步骤二、建立基于GPU并行计算的加速算法,得到MRMLM-GPU新方法;步骤三、MRMLM-GPU新方法的性能分析。本发明是在MRMLM算法上进行背景控制的上位性拓展以及GPU加速改进,MRMLM算法上位性初筛阶段,SNP以及SNP对之间相互独立,PyCUDA提供了更为简单的编程方式实现GPU的并行。本发明为预测人类疾病的互作基因提供了可行的新方法。
| 交易方 | 企业 | 个人 |
| 买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
| 专利转让委托书(需盖公章)一式两份 | 专利转让委托书(需签字)一式两份 | |
| 专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
| 卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
| 解除代理委托书(需盖公章)一式两份(如专利通过代理机构申请) | 解除代理委托书(需签字)一式两份(如专利通过代理机构申请) | |
| 专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
| 专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
| 专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
| 日期 | 法律信息 | 备注 |
| 申请号 | 专利名称 | 发布日期 |
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