发明专利已授权

一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法

📄 申请号：CN201910484769.8 📄 发布日：2026/07/23

著录项目信息

申请日

2019-06-05

公开号

CN110211640A

公开日

2019-09-06

申请人

南通大学

法律状态

已下证

专利类型

发明

主分类号

G16B40_00

IPC 分类号

G16B40_00 , G16B20_00 ,

技术画像

所属领域

生物信息学生物信息学并行计算基因关联分析

应用场景

疾病易感基因挖掘, 精准医疗, 基因组学研究, 药物靶点发现, 生物医学大数据分析

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摘要

本发明提供一种基于GPU并行计算的复杂疾病基因互作关联分析方法，包括如下步骤：步骤一、基于背景控制的主效+上位性检测算法研究，采用两阶段策略：第一阶段，在所有主效和上位性效应中，剔除无关变量，保留较少的变量；第二阶段，将通过第一阶段筛选的变量放入模型中进行最终确定变量选择方法；步骤二、建立基于GPU并行计算的加速算法，得到MRMLM-GPU新方法；步骤三、MRMLM-GPU新方法的性能分析。本发明是在MRMLM算法上进行背景控制的上位性拓展以及GPU加速改进，MRMLM算法上位性初筛阶段，SNP以及SNP对之间相互独立，PyCUDA提供了更为简单的编程方式实现GPU的并行。本发明为预测人类疾病的互作基因提供了可行的新方法。

权利要求书 (12项) 说明书附图

……

图1

图2

图3

法律状态时间线

智能氧气分离机

当前第 / 件

基于低相干光干涉的连续镜面轴上间距测量装置及方法

同领域国内专利 · IPC: (G16B40_00)

G16B40_00 G16B40_20 G16B40_30 覆盖3个领域

议价

不含过户费

📋 交易方式： 委托待转让 📌 交易状态：在售 👁️ 浏览次数：13 ❤️ 收藏人数：93 📋 项目申报： 未申报

资金托管权属尽调包过户

🏢 淄博智来知识产权服务有限公司

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