一种基于图神经网络的基因交互关系预测方法和装置，该方法包括：每个实验组的转录表达数据进行预处理，包括标准化基因ID，将不同实验组的基因转录表达数据以统一的基因ID表示；得到作为后续分析的原始数据；按照每个样本组进行基因相似度的计算，获取样本组中基因与基因之间的相似度数据；通过对所有样本组的数据进行统计和筛选，选取符合设定条件的基因对，作为构建图数据结构的基础；进一步对原始数据进行处理，保证所有样本组中仅包含图结构中定义的基因；随后，对这些样本组的数据进行标准化处理，使得所有样本组的数据维度一致；对上述生成的图数据组进行模型训练，最终得到图结构中的边权重数据，能够准确反映基因之间的交互关系。本发明可用于基因表达数据的分析，预测基因之间的交互关系，并能够在没有标签数据的情况下进行无监督学习。
📄 2024116154906
📂 G16B25_10
👤 浙江工业大学
📅 2024-11-13
本发明涉及基因分析技术领域，公开了一种生物塑料降解的功能基因在线分析平台，包括数据输入模块、功能基因分析模块、降解路径预测模块、降解路径优化模块、数据库及数据可视化模块；功能基因分析模块用于根据基因序列的比对识别出与已知降解功能基因相似的序列；降解路径预测模块用于根据识别出的功能基因模拟生物塑料的降解路径；降解路径优化模块用于通过降解路径融合优化算法对模拟的生物塑料降解路径进行优化，得到最优降解路径。本发明通过基因序列比对、功能基因注释、降解路径预测与优化等手段，可以实现对生物塑料降解路径的全面分析和优化，显著提升生物塑料的降解效率，缩短降解时间，确保其环保性。
📄 2024107345675
📂 G16B25_10
👤 浙江工业大学
📅 2024-06-07
一种基于残基信息动态选择策略的蛋白质结构预测方法，在Rosetta的基本框架下，引入距离谱和残基接触信息来弥补能量函数精确性的不足。首先，初始化构象，并针对loop区进行交叉、变异来生成新构象；然后，分别利用距离谱和残基接触信息设计两种不同的选择策略，同时根据各选择策略的历史成功信息计算其选择概率；最后，根据选择概率动态自适应地选择策略指导种群更新；迭代上述过程直至满足条件后输出结果。本发明提供一种预测精度较高的基于残基信息动态选择策略的蛋白质结构预测方法。
📄 2018108637656
📂 G16B25_10
👤 浙江工业大学
📅 2018-08-01
一种基于域间残基接触的多域蛋白结构组装方法，从各结构域的三维结构出发，利用结构比对工具对蛋白质库中所有的多域蛋白模板进行打分，并选择得分最高的模板进行组装；然后根据模板生成初始结构，并随机选择一个较小的区域进行刚体旋转和平移，从而生成新的全长结构；其次，根据域间残基接触、模板和域间原子冲突能量来评价组装结构的质量，并根据蒙特卡洛准则接受组装结构；最后，选择所有模板组装得到的结构中能量最低的结构为最终结构。本发明提供一种预测精度较高的基于域间残基接触的多域蛋白结构组装方法。
📄 2019103169067
📂 G16B25_10
👤 浙江工业大学
📅 2019-04-19
本发明公开了一种预测畜禽数量性状显性遗传效应的方法及应用，属于畜禽遗传选育技术领域。步骤如下：根据育种目标，确定亲本并测定相关性状表型数据；采集组织/血液样本，提取总RNA，获取全基因组水平的基因表达量并进行基因差异表达分析，获取与育种目标相关的差异表达基因，以及亲本间差异表达印记基因；将差异表达印记基因与差异表达非印记基因进行互作分析，获取与目标性状基因表达差异相关的差异表达印记基因，从而确定亲本的交配模式。本发明的预测畜禽数量性状显性遗传效应的方法，可大大缩短畜禽杂交育种的时间，以及节省大量的人力、物力和财力，在产犊数少，繁殖周期长，以及生长周期长的畜禽育种中具有极大的实用价值。
📄 202010339226X
📂 G16B25_10
👤 西南大学
📅 2020-04-26
本发明提供一种前疾病状态的检测方法、装置、电子设备及可读存储介质，涉及分析检测领域，该方法包括：获取与目标疾病的疾病状态相关的动态网络标志物，动态网络标志物包括每个疾病状态中，转录因子和信使RNA之间的调控网络的大小，疾病状态用于表示目标疾病的发展阶段；获取每个疾病状态对应的动态网络标志物的有效信息数值，并基于有效信息数值确定疾病状态是否为目标疾病的前疾病状态。通过利用其他状态的样本，构建基因调控网络，并使用因果涌现理论中的有效信息数值作为判断疾病状态为前疾病状态的标准，实现了更加稳定、更加准确的对前疾病状态进行识别。
📄 2024115795861
📂 G16B25_10
👤 大理大学
📅 2024-11-07
本发明提供一种单细胞miRNA海绵网络推理方法、装置、设备及存储介质，涉及基因识别技术领域。具体实现方案包括：获取多个细胞中每个细胞各自对应的多个第一靶基因的表达谱数据、多个第二靶基因的表达谱数据、以及miRNA的表达谱数据；根据预设的miRNA‑靶基因调控关系数据和每个细胞各自对应的多个第一靶基因的表达谱数据、多个第二靶基因的表达谱数据、以及miRNA的表达谱数据，确定每个细胞中的miRNA海绵竞争关系对；根据每个细胞中的miRNA海绵竞争关系对，确定每个细胞的miRNA海绵网络。本发明可以识别miRNA海绵竞争关系对，进而推理得到单细胞miRNA海绵网络。
📄 2023102409159
📂 G16B25_10
👤 大理大学,玉溪市人民医院
📅 2023-03-13
本发明提供一种基因模块群的相似性度量方法、装置、电子设备及存储介质，涉及基因识别技术领域。该基因模块群的相似性度量方法包括：获取第一基因模块群和第二基因模块群。根据公式计算所述第一基因模块和所述第二基因模块的相似性。根据所述第一基因模块和所述第二基因模块的基因模块相似性，计算得到所述第一基因模块群和所述第二基因模块群的相似性。本发明基于通过给定的公式，在计算第一基因模块群和第二基因模块群的相似性时，将基因互作关系考虑在其中，可以更加精确的度量不同基因模块群之间的相似性。
📄 2021112141782
📂 G16B25_10
👤 大理大学
📅 2021-10-19
本发明提供一种miRNA因果调控网络识别方法及装置，涉及基因识别技术领域。该miRNA因果调控网络识别方法包括：获取给定匹配样本的miRNA单细胞转录组矩阵和靶基因单细胞转录组矩阵。获取miRNA单细胞转录组矩阵和靶基因单细胞转录组矩阵的miRNA因果调控网络。将miRNA单细胞转录组矩阵和靶基因单细胞转录组矩阵中的第i个单细胞剔除，获取剔除第i个单细胞后的miRNA因果调控网络。根据miRNA因果调控网络以及剔除第i个单细胞后的miRNA因果调控网络，确定第i个单细胞的miRNA因果调控网络。由于考虑了每个单细胞的异质性，在单细胞水平下识别单细胞miRNA因果调控网络，反映真实的miRNA因果调控机制的效果。
📄 2020101460370
📂 G16B25_10
👤 电子科技大学,大理大学
📅 2020-03-03
本发明提供了多标签因果特征选择方法及系统，方法包括：获取多标签基因表达数据集，并对多标签数据集进行预处理；基于预处理后的多标签基因表达数据集，利用一元近似马尔可夫毯对每一个标签寻找近似马尔可夫毯特征；删除标签的近似马尔可夫毯中包含的其他标签，并恢复等效特征，得到标签的马尔可夫毯特征；使用对称性检验方法确保选中的特征属于标签的马尔可夫毯；将所有标签的马尔可夫毯特征进行合并，得到基因表达数据特征子集，实现对基因表达数据的特征选择。本发明采用基于因果结构与一元近似马尔可夫毯的特征选择方法，并对由于标签的等效信息导致误删的特征进行恢复，从而从根源上解决了现有的基因表达数据特征选择方法准确率低的问题。
📄 2024113812398
📂 G16B25_10
👤 重庆大学
📅 2024-09-30
本发明公开了一种基因定位方法、装置、计算机设备及存储介质。该基因定位方法通过获取待处理基因数据，所述待处理基因数据包括待检全基因组测序数据和待检转录组数据；对所述待检全基因组测序数据进行低频单核苷酸多态性筛选，获取初始基因列表；对所述初始基因列表和所述待检转录组数据进行基因共表达网络分析，获取联动基因列表；将所述初始基因列表和所述联动基因列表，投影到基因调控网络中，获取潜在异常模体；获取标准基因模体，对所述标准基因模体和所述潜在异常模体进行拓扑相似性计算，获取目标异常基因。本发明的基因定位方法可以实现对异常基因进行快速、精准地定位。
📄 2019109792009
📂 G16B25_10
👤 平安科技(深圳)有限公司
📅 2019-10-15
柿子坊 · 知识产权运营
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