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本发明涉及堤防评价技术领域，尤其涉及一种基于特征数据聚类分析的状态评估方法及系统，该方法包括以下步骤：利用工程测量仪器以及无人机获取堤防多源数据，根据堤防多源数据生成堤防实时地貌数据集；根据堤防实时地貌数据集利用矩阵分解法进行视觉投影，生成堤防实时地貌矩阵投影图；利用多因子单元区划分法对堤防实时地貌数据集进行聚类分析法划分，生成堤防多因子单元区域群组；利用可视化视图工具对堤防多因子单元区域群组进行可交互式视图处理；基于根据堤防卷积特征模型以及堤防实时地貌矩阵投影图，利用集成学习梯度提升决策树算法进行模型驱动建模，以构建堤防健康诊断模型，本发明实现了对堤防全方位，多层次的健康评价。