本发明涉及一种c‑KIT体细胞突变基因检测试剂盒及其检测方法,该试剂盒包括用于检测c‑KIT体细胞基因突变引物和探针,具体为用于检测c‑KIT基因11号外显子的引物和探针,引物序列如SEQ ID NO:1‑6所示,探针序列如SEQ ID NO:7‑8所示;用于检测c‑KIT基因9号外显子的引物和探针,引物序列如SEQ ID NO:9‑10所示,探针序列如SEQ ID NO:11所示;用于检测c‑KIT基因13号外显子的引物和探针,引物序列如SEQ ID NO:12‑14所示,探针序列如SEQ ID NO:15所示;用于检测c‑KIT基因17号外显子的引物和探针,引物序列如SEQ ID NO:16‑19所示,探针序列如SEQ ID NO:20所示。本发明的检测试剂盒及检测方法检测位点数远比同类产品多、位点齐全、检测灵敏度高、特异性强、准确度高,成本低,可满足临床GIST靶向用药c‑KIT突变检测。
本发明公开了一种基于信息SNP集及其引物的核酸质谱亲权鉴定方法,该方法中使用的信息SNP集是基于40个人群的数据分析,具有较高的杂合率>0.4,群体遗传指数Fst<0.06,和较低的突变频率<0.01%,随机人群匹配率<10‑15,适合个体身份识别和亲子鉴定,其中30个信息SNP标记的上游引物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.1~30所示,下游引物的核苷酸序列依次如SEQ ID NO.31~60所示,单碱基延伸引物核苷酸序列依次如SEQ ID NO.61~90所示。经过飞行质谱检测信息SNP多态以及亲子推断试验验证,鉴定结果与实际亲缘关系吻合;本发明提供的信息SNP集用于人类亲权鉴定,结果准确,优选利用质谱方法,可快速、高通量、简便的进行基因分型,从而计算亲权指数并进行亲子判断,具有准确度高,成本低等优点。