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本发明提供了以蛋白聚集体‑多糖为壁材的益生菌微胶囊及制备方法，其制备方法为：米糠蛋白在低pH下形成聚集体和多糖溶液按照一定的体积比(1:1–10:1)进行混合，在形成的混合液中加入益生菌菌悬液和适量的乳化剂(吐温‑80)轻轻搅拌均匀，此时形成稳定的乳液，在不断搅拌下加入1％的醋酸溶液于混合溶液中使其最终pH为3.8‑4.0，最后加入固化剂(没食子酸)对微胶囊固化后，用蒸馏水洗涤最终得到益生菌微胶囊产品。本发明只需要通过控制蛋白聚集体和多糖的配比及其交联的时间就可达到交联的目的，制备的益生菌的微胶囊能够提高对胃酸的抵抗力，最终会在肠道内释放被人体吸收，并且具有良好的储藏性。