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摘 要:一种基于抽象凸下界估计的蛋白质结构预测方法,包括以下步骤:首先针对蛋白质高维构象空间采样难题,采用一系列变换方法将ECEPP/3力场模型转换为单位单纯性约束条件下的递增射线凸函数;基于抽象凸理论,证明并分析给出了递增射线凸函数的支撑超平面集;然后,在差分进化群体算法框架下,基于群体极小化构象次微分知识构建下界低估支撑面;进而,通过低估支撑面极值点快速枚举方法,逐步减小构象采样空间以提高采样效率;同时,利用下界低估支撑面快速廉价地估计原势能模型能量值,有效减少势能模型目标函数的评价次数;最后,甲硫氨酸—脑啡肽(TYR1-GLY2-GLY3-PHE4-MET5)构象空间优化实例验证了本发明的有效性。本发明提供一种可靠性高、复杂性较低、计算效率高的基于抽象凸下界估计的蛋白质结构预测方法。
著 录 项:
专利/申请号: | CN201310329575.3 | 专利名称: | 一种基于抽象凸下界估计的蛋白质结构预测方法 |
申请日: | 2013-07-30 | 申请/专利权人 | 浙江工业大学 |
专利类型: | 发明 | 地址: | 浙江省杭州市下城区潮王路18号 |
专利状态: | 已下证 查询审查信息 | 分类号: | G06F19/16搜分类 蛋白搜索 |
公开/公告日: | 转让价格: | 面议 | |
公开/公告号: | 交易状态: | 等待洽谈 搜索相似专利 |
交易方 | 企业 | 个人 |
买家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(签字) |
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卖家 | 营业执照副本复印件(需盖公章) | 身份证复印件(需申请人签字) |
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专利转让协议(需盖公章)一式两份 | 专利转让协议(需签字)一式两份 | |
专利请求书或手续合格通知书、授权通知书复印件 | 专利请求书或手续合格通知书、专利授权通知书复印件 | |
专利证原件(若授权下证) | 专利证原件(若授权下证) |
日期 | 法律信息 | 备注 |
2016/06/15 | 授权 | |
2013/12/18 | 实质审查的生效 | IPC(主分类): G06F 19/16 专利申请号: 201310329575.3 申请日: 2013.07.30 |
2013/11/27 | 公开 |